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Le groupe CEN1 WG275/TAG4 va achever d'ici à 2012 le développement de méthodes consensuelles d'extraction et de détection par RT-PCR en temps réel des Norovirus et du Virus de l'Hépatite A dans les matrices alimentaires. Ces travaux vont probablement aboutir à la mise en place d'une réglementation européenne imposant des contrôles virologiques des aliments à risque, parmi lesquels les mollusques bivalves (cf. Paquet Hygiène). La RT-PCR permet de détecter spécifiquement de faibles quantités de génome dans un échantillon, mais ne renseigne pas sur le risque infectieux pour le consommateur. Un programme OFIMER2 finalisé en 2008 a mis en évidence la présence de génomes de Norovirus dans un nombre important de lots de mollusques importés surgelés précuits (~20%, n=83). La présence de virus infectieux associés n'a pas pu être recherchée du fait de l'absence de cellules permissives pour les norovirus humains. Les objectifs de ce projet sont :
- d'utiliser des virus entériques modèles (VHA, MNV3) pour évaluer, en mesurant simultanément la présence de génome viral (RT-PCR) mais également de particules infectieuses (culture cellulaire), l'efficacité virucide des traitements thermiques industriels utilisés pour le dé-coquillage et la cuisson des mollusques bivalves (vapeur, eau bouillante),
- de tester un prétraitement enzymatique permettant de ne détecter en RT-PCR que les particules infectieuses.

1 Comité Européen de Normalisation, groupe de travail WG275/TAG4 « Detection of viruses in food » ;
2 Programme OFIMER n° 054/06/C « Risques sanitaires émergents dans les produits de la mer importés surgelés », porté par le Syndicat National du Commerce Extérieur (SNCE) ;
3 VHA : virus de l'hépatite A ; MNV : norovirus murin.

Ce projet a été labellisé par le Pôle de Compétitivité AQUIMER le 23 avril 2009.

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